肖辉

一、个人简介

肖辉，博士，教授，博士生导师。2009年10月毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所，获理学博士学位。2009年10月至2014年10月在美国斯克瑞普斯研究所（The Scripps Research Institute）细胞生物学系、免疫与微生物系从事博士后研究，博士后研究工作得到美国Cancer research institute博士后奖学金资助。2014年10月至2016年7月为美国圣犹达儿童研究医院（St. Jude Children’s Research Hospital）发育神经生物学系Research Associate。2015-至今为js33333金沙线路检测教授，承担研究生《高级细胞生物学》和本科生《细胞生物学》等课程教学。主要以模式动物秀丽线虫(Caenorhabditis elegans)和黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)为模式，围绕凋亡细胞清除的调控机制进行研究。在凋亡细胞清除的研究领域取得了国际同行公认的结果，相关研究成果以第一作者或通讯作者身份发表在Science、Neuron、Developmental Cell、Elife、PLoS Genetics、Cell Death and Differentiation等国际一流刊物上，并承担过凋亡细胞清除专业领域国际会议（Gordon Research Seminar on Apoptotic Cell Recognition & Clearance in 2013）Associate Chair。同时，相关成果得到国家自然科学基金的资助。

学术兼职：陕西省细胞生物学学会副理事长、中国细胞生物学会细胞器分会委员、美国发育生物学协会（SDB）会员。

审稿人：Communication Biology, Frontiers in physiology, Plos One, Life Sciences,Molecular and Cellular Biochemistry, Biological Chemistry, Journal of diabetes and its complications等。

二、主要研究领域及兴趣

细胞程序性死亡又称细胞凋亡，对多细胞生物体的发育、组织和器官的动态稳定至关重要。细胞凋亡的全过程分为几个重要的步骤，包括死亡信号启动和传递、死亡程序触发及其后凋亡细胞的清除（包括凋亡细胞的识别、吞噬与降解）。凋亡细胞的清除是细胞凋亡程序不可或缺的环节，凋亡细胞的清除障碍会导致多种疾病的发生：如肺部未被正常清除的凋亡细胞引起继发性坏死，进而引起肺部炎症，造成慢性阻塞性肺病(COPD)；血液中含有低密度脂蛋白的“foam cells”凋亡清除异常导致动脉粥样硬化等）；免疫紊乱（如系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus，SLE)）；神经退行性疾病（如脑中小胶质细胞对凋亡的神经元清除异常引起的阿尔兹海默症等）以及肿瘤（如一些肿瘤细胞高表达“don’t eat me”不吃我信号逃避免疫监控）。而且吞噬基因的突变与人类疾病密切相关：如Elmo1的内含子区域的点突变与糖尿病肾病有关，ELMO也能与Dock180和Rac协同促进胶质母细胞瘤的侵袭表型；吞噬相关基因MFG-E8以及C1q等的突变出现在人类精神疾病中，包括阿尔茨海默病、精神分裂症和多种类型的癌症。细胞凋亡在进化上从原生动物线虫到高等动物人的多细胞生物中高度保守。因此利用模式动物秀丽线虫和黒腹果蝇研究凋亡细胞清除的调控机制能使人们更好地认识与凋亡细胞清除障碍相关的多种疾病的分子基础，对开发新的药物以治疗神经退行性疾病和自身免疫系统等疾病有极大的指导作用。并且确定这些基因在疾病中的贡献，并了解它们与吞噬和非吞噬相关的细胞信号传递的关系，将有助于解开一些复杂的疾病病理。肖辉实验室主要以模式动物秀丽线虫、黒腹果蝇、小鼠以及体外培养细胞等作为模型系统，综合运用遗传学、细胞生物学、生物化学及分子生物学等手段发现凋亡细胞清除的新的调控因子并揭示它们参与凋亡细胞清除的作用机制。

主要研究领域有如下几方面：

1.研究E3泛素连接酶Pallbearer,泛素化及蛋白酶体降解途径参与凋亡细胞清除的机制。

2.利用果蝇巨噬细胞系细胞S2细胞，已经完成了全基因组的RNAi筛选，发现了300多个影响凋亡细胞清除基因，将挑选参与细胞囊泡运输和钙离子稳态的基因进行进一步研究。

3.运用正向和反向遗传等综合手段，筛选出的新作用分子，探索凋亡细胞清除的调控规律，并应用哺乳动物系统进一步验证和研究功能。

本实验室有一流的模式生物研究平台，欢迎有兴趣者报考本实验室的硕士、博士研究生，加入本研究团队；也欢迎相关领域本科生、博士后工作者加盟，从事短期或长期的研究工作。

三、承担的科研项目

1.主持国家自然科学基金面上项目，“分泌蛋白SPARC在凋亡细胞清除中的作用及分子机制研究”，2024.01.01-2027.12.31，项目批号32370799

2.主持国家自然科学基金重大研究计划（培育）项目“内质网–质膜互作在凋亡细胞磷脂酰丝氨酸外翻过程中的作用机制研究”,2020.01.01-2022.12.31,项目批号91954114

3.主持国家自然科学基金面上项目，“SUMO化修饰在秀丽线虫凋亡细胞清除中的分子机制研究”，2019.01.01-2022.12.31，项目批号31871387

4.主持国家自然科学基金面上项目，“E3泛素连接酶Pallbearer介导凋亡细胞清除的分子机制研究”，2017.01.01-2020.12.31，项目批号31671439

四、代表性论文(*共同第一作者，#通讯作者）

1.Ma Ai*, Feng Q*, Li P*, Yuan L,Xiao H#.SCAV-3 affects apoptotic cell degradation inCaenorhabditis elegans.FEBS Open Bio. 2023 May;13(5):867-880.

2.Yuan L*, Li P*, Jing H, Zheng Q,Xiao H#.trim-21promotes proteasomal degradation of CED-1 for apoptotic cell clearance inC. elegans.Elife. 2022 Aug 5;11:e76436.

3.Gao N*, Zheng Q*, Wang Y*, Li X, Li Z,Xiao H#. Wun2-mediated integrin recycling promotes apoptotic cell clearance inDrosophila melanogaster.Cell Death and Differentiation. 2022 Jul 15. doi: 10.1038/s41418-022-01039-3.

4.Yuan L*, Li P*, Zheng Q, Wang H#,Xiao H#. The Ubiquitin-Proteasome System in Apoptosis and Apoptotic Cell Clearance.Front Cell Dev Biol. 2022 Jul 6;10:914288.

5.Zheng Q*, Gao N*, Sun Q*, Li X, Wang Y,Xiao H#.bfc, a novel serpent co-factor for the expression of croquemort, regulates efferocytosis inDrosophila melanogaster.PLoS Genet.2021 Dec 3;17(12):e1009947

6.Jinlong Wan*, Lei Yuan*, Huiru Jing, Qian Zheng,Hui Xiao#.Defective apoptotic cell clearance activates innate immune response to protectCaenorhabditis elegansagainst pathogenic bacteria.Virulence.2021 Dec;12(1):75-83.

7.Zheng Q, Ma A, Yuan L, Gao N, Feng Q,Franc NC#, Xiao H#.Apoptotic Cell Clearance inDrosophila melanogaster.Front Immunol.2017 Dec 20;8:1881.

8. Xiao H, Wang H, Silva EA, Thompson J, Guillou A, Yates JR Jr, Buchon N, Franc NC#. The Pallbearer E3 ligase promotes actin remodeling via RAC in efferocytosis by degrading the ribosomal protein S6.Developmental Cell.2015 Jan 12;32(1):19-30.

9.Han C*, Song Y*,Xiao H, Wang D, Franc NC, Jan LY#, Jan YN#. Epidermal cells are the primary phagocytes in the fragmentation and clearance of degenerating dendrites inDrosophila.Neuron.2014 Feb 5;81(3):544-60.

10.Chen D*,Xiao H*, Zhang K, Wang B, Gao Z, Jian Y, Qi X, Sun J, Miao L, Yang C#. Retromer Is Required for Apoptotic Cell Clearance by Phagocytic Receptor Recycling.Science.2010, 327(5970):1261-4. (* denotes co-first authorship)

11.Xiao H, Chen D, Fang Z, Xu J, Sun X, Song S, Liu J, Yang C#. Lysosome biogenesis mediated by vps-18 affects apoptotic cell degradation inC. elegans.Molecular Biology of the Cell.2009, 20(1):21-31.

12.Shen Q*, Qin F*, Gao Z*, Cui J, Xiao H, Xu Z, Yang C#. Adenine nucleotide translocator cooperates with core cell death machinery to promote apoptosis inC. elegans.Molecular and Cellular Biology, 2009, 29(14):3881-93